生物工程
培养目标：培养具备生物工程专业的科学原理、工艺技术和工程设计等方面的基本理论与技能，能够在生物技术与工程等相关领域从事生物制品的工程设计与生产、技术开发和服务、科学研究与应用、生产组织与管理等方面工作，适应经济社会发展、具有创新精神和实践能力、能解决复杂生物工程问题的高素质应用型人才。
专业核心课程：普通生物学、生物化学、化工原理、微生物学、分子生物学、细胞生物学、基因工程、发酵工程、细胞工程、酶工程、生物工程设备、生物分离工程。
就业与发展方向：毕业生可在生物技术、医药、食品、环保、商检等行业从事生物产品的技术开发及生产、工程设计、生产管理及产品性能检测分析等工作，在高校院所从事本专业领域的技能培训及科研工作，也可在生命科学与工程、生物医药等相关领域继续读研深造。
食品科学与工程
培养目标：本专业培养具备食品科学、食品工程、食品质量管理与安全监控等方面的基础理论知识和实践技能，能够在食品（特别是生鲜农产品）的加工、贮藏、流通、监管等领域，从事食品或相关产品的技术开发、工程设计、生产管理、品质控制、检验检疫、产品销售、科学研究等方面工作的高素质应用型人才。
专业核心课程：生物化学、微生物学、食品化学、食品工程原理、食品工艺学、食品分析、食品机械与设备、食品营养学、食品工厂设计、食品安全与卫生学。
就业与发展方向：毕业生可在食品领域从事生产、管理、检验、研发、设计等工作，在工商、海关、质检等部门从事管理、检测、执法、科研等工作，也可在食品科学与工程、微生物与发酵工程、生物与医药、生命科学等领域读研深造。
食品科学与工程(中外合作办学，与意大利福贾大学合作)
培养目标：本专业培养具有较高的英语交流能力，具备食品科学、食品工程、食品质量管理与安全监控等方面的创新创业能力，能够在食品相关领域从事技术开发、工程设计、生产管理、品质控制、检验检疫等工作，具有国际化视野和良好的社会责任感与职业道德的高素质应用型人才。食品科学与工程专业为省一流专业。
专业核心课程：生物化学、食品企业经济学与管理*、微生物学、食品化学、分析化学*、食品卫生与人类营养*、食品工艺学概论、食品工程原理、食品分析、食品微生物学*、植物食品生产*、食品的化学、物理和感官分析*、食品机械与设备、食品安全学*、食品科学研究方法*、协调操作*、动物制品*、食品技术工艺*。（标*为外方课程）
就业与发展方向：毕业生可在国内外食品相关领域从事技术开发、工程设计、生产管理、品质控制、检验检疫等工作，也可在食品科学与工程、微生物与发酵工程、生物与医药、生命科学等领域读研或出国深造。
酿酒工程
培养目标：本专业面向酒类生产、设计及销售第一线，培养具备良好的职业道德和创新精神，具备酒类生产所需的技术与专业基础理论知识，熟练掌握酿酒工艺原理、工程设计、设备操作和企业管理的理论与实践技能，有较高的酒体设计、产品开发、设备操作、问题排查、生产创新等能力的，德、智、体、美、劳全面发展的高素质应用型人才。
专业核心课程：生物化学、食品工程原理、微生物学、发酵工程、啤酒工艺学、葡萄酒工艺学、白酒工艺学、黄酒工艺学、酿酒分析、酿酒工程设备、酒厂设计等。
就业与发展方向：经过理论与实践教学训练之后，可在酿酒相关生产企业、检测机构、研究单位从事生产管理、产品开发、品质监控、工程设计、酒文化推广等工作。
生物制药
培养目标：培养德、智、体、美、劳全面发展，具有良好的思想道德修养和身心素质、较高的文化品质和科学素养，具备具有生物学、化学、药学和工程学的基础知识和生物制药工程专业知识，能够从事药品及其他生物品的技术开发和工程设计，适应经济社会发展、具有创新精神和实践能力的高素质应用型人才。
专业核心课程：普通生物学、生物化学、微生物学、分子生物学、药理学、药剂学、药物化学、基因工程、发酵工程、生物制药工艺学、生物药物分析与检验、生物制药设备。
就业与发展方向：毕业生在医药公司、科研院所和高等院校等单位从事药物研究与开发、生产、经营和管理、检验及外贸、医药代表等工作。考取执业药师证，考取研究生。
药品生物技术（专科）
培养具有良好的道德修养和身心素质、较高的人文素养、科学素养和艺术素养，具备扎实的生物技术和制药方面专业知识、能力、素质，具有运用生物学和药学原理解决生物制药生产实际问题的实践能力，能在生物医药企业、药检和药事管理等相关部门从事生物医药产品的生产、质量管理与控制、工艺改造等方面工作，具有创新精神和实践能力的高素质应用型人才。
优秀师资代表
尹春光，女，博士，教授，济宁学院党委委员、副校长，硕士研究生导师，山东省高校优秀共产党员，山东省重点学科、山东省卓越工程师计划项目、山东省高水平应用型专业群、山东省一流专业负责人。
李明丽，⼥，博士，教授，硕士研究生导师，山东省泰山产业领军人才，济宁市中青年突出贡献专家，济宁市创新创业领军人才。
杜秋丽，女，博士，教授，济宁市林学会副理事长，济宁市自然科学学科带头人，济宁学院"31353"人才工程校级优秀专业人才，优秀教师、三八红旗手、优秀党员，省级一流课程主讲教师。
李湘利，男，教授，“食品科学与工程”山东省一流本科专业负责人，济宁市自然科学学科带头人，济宁学院“31353”工程优秀专业人才、十大师德标兵、优秀教师。
彭浩，女，副教授，济宁学院教学名师，教书育人楷模，优秀教师。山东省一流本科课程负责人，获山东省高校青年教师信息化教学比赛一等奖。
学院领导寄语
